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iDeCoの年末調整・確定申告を解説|節税額と手続き方法

iDeCo

iDeCo(個人型確定拠出年金)は、自分で老後資金を準備するための私的年金制度です。

大きな特徴は、税制上の優遇を受けながら老後資金を積み立てられること。

iDeCoには、

  • 掛金を支払うとき
  • 運用しているとき
  • 老齢給付金を受け取るとき

という3つの場面で税制上のメリットがあります。

なかでも、現役時代に実感しやすいのが「掛金の全額が所得控除になる」というメリットです。

ただし、この所得控除を受けるためには、会社員なら年末調整、自営業・フリーランスなどは確定申告で所定の手続きが必要になる場合があります。

この記事では、iDeCoの掛金によって所得税・住民税がどのように安くなるのか、年末調整や確定申告では何をすればよいのかをわかりやすく解説します。

※参考:iDeCoってなに?

iDeCoの掛金は「小規模企業共済等掛金控除」の対象

まずは、所得税がどのように計算されるのかを簡単に確認しておきましょう。

ステップ1:所得を計算する

会社員の場合、給与収入から「給与所得控除」を差し引いて給与所得を計算します。

自営業・フリーランスの場合は、基本的に事業収入から必要経費を差し引いて事業所得を計算します。

ステップ2:所得控除を差し引く

所得から、基礎控除、社会保険料控除、扶養控除、生命保険料控除などの「所得控除」を差し引いて、税金を計算する基礎となる課税所得を求めます。

iDeCoの加入者が自分で支払った掛金は、この所得控除の一つである「小規模企業共済等掛金控除」の対象です。

その年に支払ったiDeCoの掛金は、原則として全額を所得から差し引くことができます。

ステップ3:所得税率をかけて税額を計算する

課税所得に応じた所得税率をかけて所得税額を計算します。

所得税は累進課税となっており、2026年時点では課税所得に応じて5%から45%までの税率が設定されています。

その後、住宅ローン控除など適用できる税額控除があれば、所得税額から差し引きます。

つまりiDeCoは、

「税金を計算する前の所得そのものを減らす仕組み」

と考えるとわかりやすいでしょう。

 

iDeCoで所得税・住民税はいくら安くなる?

では、実際にどのくらい節税できるのでしょうか。

たとえば、

・iDeCo掛金:月1万円
・年間掛金:12万円
・所得税率:10%
・住民税所得割:10%

と仮定します。

単純計算すると、

120,000円 ×(10%+10%)=24,000円

となり、所得税と住民税を合わせて年間約2万4,000円の負担軽減が期待できます。

※実際の税額は所得状況、各種所得控除、復興特別所得税などによって異なるため、上記は概算です。

生命保険料控除などには控除額の上限がありますが、iDeCoの加入者掛金については、その年に支払った金額の全額が小規模企業共済等掛金控除の対象になります。

たとえば年間24万円を拠出すれば、原則として24万円全額が所得控除の対象です。

これはiDeCoの大きなメリットといえるでしょう。

ただし、

「掛金を増やせば誰でも同じ割合で得をする」わけではありません。

所得税率は「年収」そのものではなく、所得から所得控除を差し引いた課税所得によって決まります。

また、もともと所得税や住民税がほとんどかかっていない人は、所得控除を増やしても税負担を減らす余地が小さいため、節税効果も小さくなります。

 

iDeCoの年末調整はどうすればいい?

会社員がiDeCoの掛金について所得控除を受ける場合、掛金の納付方法によって手続きが異なります。

個人払込の場合

本人の銀行口座からiDeCoの掛金を支払っている「個人払込」の場合は、年末調整で手続きします。

例年秋ごろになると、国民年金基金連合会から「小規模企業共済等掛金払込証明書」が発行されます。

勤務先から渡される「給与所得者の保険料控除申告書」の、

「確定拠出年金法に規定する個人型年金加入者掛金」

の欄に払込証明書に記載された金額を記入し、勤務先へ提出します。

控除証明書はハガキだけでなく、電子データを利用することもできます。

事業主払込なら基本的に証明書の提出は不要

会社員のiDeCoには、勤務先が給与から掛金を天引きして納付する「事業主払込」もあります。

この場合、勤務先が給与から差し引いた掛金額を把握しているため、個人払込のような「小規模企業共済等掛金払込証明書」は発行されません。

勤務先が把握している掛金額をもとに年末調整が行われます。

そのため、

「iDeCo加入者は全員、年末調整で払込証明書を提出する」わけではありません。

自分が個人払込なのか事業主払込なのかを確認しておきましょう。

 

確定申告でiDeCoの所得控除を受ける方法

自営業者やフリーランスなど、年末調整を受けない人は確定申告でiDeCoの所得控除を申告します。

確定申告書の「小規模企業共済等掛金控除」の欄に、その年に支払ったiDeCo掛金を入力します。

払込証明書または電子データなどを利用して手続きします。

また、会社員でも次のような場合は確定申告で控除を受けることができます。

  • 年末調整でiDeCoの申告を忘れた
  • 払込証明書が年末調整に間に合わなかった
  • そもそも確定申告をする必要がある

つまり、

年末調整を忘れたからといって、iDeCoの所得控除を受けられなくなるわけではありません。

確定申告で申告すれば対応できます。

 

iDeCoの払込証明書はいつ届く?

個人払込を利用している人には、国民年金基金連合会から「小規模企業共済等掛金払込証明書」が発行されます。

例年、10月ごろから順次発行されます。

ただし、その年の途中からiDeCoを始めた場合などは発行時期が遅くなることがあります。

特に初回の掛金納付が秋以降になった場合は、年末調整の期限に間に合わないケースがあります。

その場合は、無理に年末調整へ間に合わせようとせず、確定申告で小規模企業共済等掛金控除を申告すれば問題ありません。

また、控除証明書は電子データで受け取る方法も用意されています。

年末調整や確定申告をオンラインで行う方は、電子交付を活用すると入力の手間を減らせる場合があります。

 

年末調整で所得税が戻ってくるのはなぜ?

会社員の場合、毎月の給与や賞与から所得税が源泉徴収されています。

ただし、この時点で年間の正確な所得税額が確定しているわけではありません。

毎月の源泉徴収税額は、給与額や扶養親族等の人数などをもとに源泉徴収税額表によって計算されています。

一方、年間の所得税額を確定する際には、

  • 1年間の給与総額
  • 扶養状況
  • 生命保険料控除
  • 地震保険料控除
  • iDeCoの掛金
  • 基礎控除

などを反映させる必要があります。

そこで年末に、1年間に源泉徴収した所得税額と、本来納めるべき所得税額との差額を精算します。

これが「年末調整」です。

iDeCoの所得控除を年末調整で申告すると課税所得が少なくなるため、すでに天引きされていた所得税の一部が還付されることがあります。

 

住民税は年末調整で還付されるわけではない

ここは間違いやすいポイントです。

iDeCoによる所得控除は所得税だけでなく住民税にも反映されますが、

所得税と住民税では、税負担が軽くなるタイミングが異なります。

会社員の場合、所得税は年末調整によって精算されるため、払い過ぎた税金があれば給与と一緒に還付されることがあります。

一方、住民税は前年の所得をもとに計算されます。

そのため、今年支払ったiDeCo掛金による所得控除は、原則として翌年度の住民税に反映されます。

給与から住民税が天引きされている会社員であれば、通常は翌年6月以降の住民税額に反映される形になります。

「iDeCoで年間2万円節税できた」といっても、その2万円がまとめて現金で戻ってくるとは限らない点は覚えておきましょう。

 

iDeCoによる節税効果を使ってしまわない工夫も大切

iDeCoで所得税や住民税の負担が軽くなっても、

その分を日々の生活費として使ってしまえば、資産形成という意味では効果を実感しにくくなります。

所得税の還付金があれば貯蓄用口座に移す、翌年度に住民税が下がった分を積み立てに回すなど、「節税できた分」を見える形で残しておくのも一つの方法です。

家計に余裕があるのであれば、NISAなど別の資産形成制度と組み合わせる方法もあります。

iDeCoは原則として60歳まで自由に引き出せない一方、NISAで保有する資産は必要に応じて売却できます。

そのため、

老後資金はiDeCo、途中で使う可能性のある資金は預貯金やNISA

など、それぞれの制度の特徴を理解して使い分けることが大切です。

※参考:iDeCoってなに?

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iDeCoと年末調整・確定申告まとめ

iDeCoの年末調整と確定申告

iDeCoの大きな魅力の一つが、支払った掛金の全額を「小規模企業共済等掛金控除」として所得から差し引けることです。

課税所得がある人であれば、所得税だけでなく翌年度の住民税の負担軽減も期待できます。

会社員の場合は、

個人払込 → 払込証明書を使って年末調整

事業主払込 → 勤務先が掛金額を把握して年末調整

という違いがあります。

自営業・フリーランスの方や、会社員でも年末調整で申告できなかった方は確定申告で手続きできます。

ただし、iDeCoは「掛金を払えば必ず得をする制度」というわけではありません。

所得控除による節税効果は、その人の課税所得や所得税率によって異なります。

また、原則60歳まで自由に引き出せないため、節税効果だけで掛金を決めるのではなく、生活費や緊急予備資金を確保したうえで無理のない金額を設定することが大切です。

iDeCoは、老後資金を準備しながら税負担を軽減できる有力な選択肢の一つです。

制度の仕組みを理解し、年末調整や確定申告を忘れずに行って、税制メリットをしっかり活用していきましょう。

 

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